ОАНО «Елизаветинский лицей» действует образовательная программа индивидуального подхода к каждому ученику. Она разработана для того, чтобы ребенок, смог найти для себя именно ту сферу деятельности, в которой будет успешен в будущем.
Процесс обучения проходит согласно общеобразовательным программам начального, основного и среднего общего образования в соответствии с государственными образовательными стандартами Министерства просвещения Российской Федерации. В первой половине дня ученики посещают общеобразовательные уроки. После обеда и полноценного отдыха на свежем воздухе, выделяется время для самоподготовки, а также занятий в творческих кружках и спортивных секциях.